2018年08月18日  | 入会申请 | 游客注册
  • 登录
用户名:
密码: 忘记密码
确定 取消
您当前的位置:新闻中心 - 学术前沿

中科院建立空间转录组学新技术

发布时间:2018-01-19

近日,中科院生物化学与细胞生物学研究所细胞生物学国家重点实验室等处的研究人员作建立了一种可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱的技术方法:Geo-seq,这种方法不仅能解析少量细胞转录组信息,而且还能保留细胞原有位置信息。

研究人员通过整合与优化单细胞测序和激光显微切割技术,构建了一种能够获得、同时保留细胞原有位置信息的测序方法:Geo-seq。Geo-seq是一种高效、高分辨率的空间转录组分析方案,既可用于转录图谱的三维重建,也可以用于研究具有特殊结构的少量组织或细胞的转录组信息。

利用Geo-seq技术,这一课题组绘制了小鼠早期胚胎原肠运动中期精细的三维分子图谱,并揭示了小鼠细胞谱系蓝图建立过程中的空间转录组特征、转录因子和信号通路调控网络,这也就是上文提到的内容。研究人员由此构建了整个原肠运动中期高质量的全胚胎基因表达三维分子图谱,使得小鼠这一时期两万多个基因的表达能够以电子原位杂交的形式得到完全的呈现。更重要的是,该项工作还鉴定了一组能够代表E7.0时期发育状态和特异空间结构域的标志基因,这些基因具有类似“邮政编码”(zip code)的标记功能,可以将外源的多能干细胞或者胚胎组织细胞“投递”到体内胚胎的特定位置,从而将未知来源的干细胞定位于体内胚胎的相应部位。

(信息来源:生物通)