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半导体测序仪iSeq 100深入解析

发布时间:2018-01-19

一年一度的摩根大通医疗保健大会于近日在美国旧金山召开。这是生命科学行业中规模最大的医疗投资研讨会,吸引了来自全球的医药企业、生物科技公司、医疗器械、医疗服务和投行高管参加。

近日,Illumina的CEO Francis deSouza登上了演讲台,总结了测序巨头Illumina过去一年的成绩,强调了预期的增长领域(包括消费者基因组学和无创产前检测),并宣布推出iSeq 100测序系统以及与赛默飞世尔在文库制备上的合作。

deSouza表示,2017年对Illumina来说是辉煌的一年。因测序平台的采用以及消费者和临床基因组学的增长,去年的营业收入约为27.5亿美元。测序消耗品的业务增长了30%。该公司已经安装了11,000台系统,去年上市的NovaSeq已经发售285台,而NextSeq已发售600台。超过4,000台系统已连接到BaseSpace云计算平台。

按照以往的惯例,deSouza宣布了Illumina最新的测序平台—iSeq 100测序系统。不知大家是否记得,两年前的JP Morgan 大会上,Illumina当时的CEO Jay Flatley曾介绍过,不过那时称为Firefly。Flatley预测仪器将在2017年下半年上市,售价低于30,000美元。

iSeq 100测序系统结合了成熟的边合成边测序(SBS)技术以及互补金属氧化物半导体(CMOS)检测技术,代表了与以往完全不同的架构,在产出高精度数据的同时成本大大下降。这是第一款采用此架构的系统,在美国标价为19,900美元(此价格仅适用于美国)。每个样本的费用大约在25-115美元。

iSeq 100的占地面积仅为30.5 cm x 33 cm,大概跟一台PCR仪差不多,是Illumina有史以来最小巧的测序仪。安装过程非常简单,用户可在一小时内完成。它每次运行可产生400万条序列和1.2 Gb的数据。据介绍,测序运行可在9到18小时内完成,具体取决于应用。

deSouza谈道:“十年前,我们推出了Genome Analyzer。现在,我们有了iSeq。与Genome Analyzer相比,iSeq的大小为1/20,价格也为1/20,但运行速度快了五倍,每次运行的产量也更高。”

DeSouza表示iSeq平台带来了与Illumina其他台式测序仪相同的出色质量和性能。“高质量和低成本的结合实现了广泛的应用,并且在价格上极具吸引力,”他说。此平台可应用于小型基因组测序、靶向测序、宏基因组学、基因编辑的验证等领域。

由于采用卡盒设计,Illumina能够在不改变硬件的前提下扩展系统的性能。据deSouza介绍,内部研发团队已经证实,测序速度提升了15%。CMOS传感器可带来四到五倍的序列。他相信,最终产量将达到10 Gb,且运行时间只需要几小时,从而轻松实现更高通量的应用。

Illumina预计iSeq 100的客户将来自核心实验室和服务实验室,他们需要高效地管理小批量的项目,需要快速周转。其他一些现有客户计划用iSeq来进行NGS文库的质量控制,之后再开展更高通量的运行。未来,deSouza认为iSeq将用于医源性传染的监控、食源性病原体的检测以及快速微生物组测序。

哈佛大学陈曾熙公共卫生学院免疫学和传染病教授Pardis Sabeti博士说:“我们预计实验室研究人员将会主要在监测传染病方面使用此款仪器。在以往的案例中,我们已经看到了Illumina的台式系统,例如MiSeq,在理解和处理疾病爆发中如何发挥了重大作用。相信iSeq 100的精准、低价和小巧体积一定能够让我们在最需要的地方发挥NGS的威力。”

(信息来源:生物通)